Микобактериальные заболевания
Открытый доступ

Абстрактный

Использование ультразвука в качестве быстрого метода предварительной обработки для MALDI-TOF MS микобактериальных образцов

Кацунао Ниицума, Шизуко Косиба, Мивако Сайто, Томоко Судзуки, Кинуё Чикамацу, Акико Такаги и Сатоши Митарай

Предыстория : В Японии матрично-ассистированная лазерная десорбционная ионизация-времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) используется как простой и точный метод идентификации микобактерий, но существующие методы предварительной обработки требуют много времени и трудоемки.
Цель : Мы охарактеризовали новый метод предварительной обработки, который извлекает белки с помощью ультразвукового разрушения.
Методы : Мы сравнили этот новый метод с текущим методом предварительной обработки и изучили полезность ультразвуковой обработки, включая ее использование для инактивации микобактерий. Всего было протестировано 174 изолята микобактерий, включая 50 штаммов комплекса Mycobacterium tuberculosis , 57 штаммов Mycobacterium avium , 55 штаммов Mycobacterium intracellulare и 12 штаммов Mycobacterium kansasii . Метод ультразвуковой предварительной обработки выполнялся с предварительной тепловой обработкой или без нее при температуре 95 °C в течение 30 минут параллельно с текущим традиционным методом. Для всех протестированных штаммов идентификация микобактерий совпала при сравнении новых и традиционных методов.
Результаты : Образцы, подготовленные с помощью ультразвука без предварительной тепловой обработки, показали множественные существенные различия по сравнению с образцами, подготовленными с помощью ультразвука с предварительной тепловой обработкой или традиционными методами. Однако большинство оценок были выше 2,0, а самая низкая оценка превысила 1,7. Кроме того, новые методы можно было выполнить всего за 10 минут для диагностики. Кроме того, мы подтвердили, что 1 минута предварительной ультразвуковой обработки обеспечивала полную инактивацию штаммов комплекса M. tuberculosis .
Заключение : Более быстрая методика извлечения/инактивации белка с помощью ультразвука без предварительной тепловой обработки, как ожидается, будет весьма полезна в клинических лабораторных условиях.