ISSN: 2471-9552
Синьхуэй Ван*, Баолинь Чжоу, Лэй Цинь, Цзюнь Куай, Фан Ян, Лу Ян, Ланьфан Чжан, Пэйшэн Сунь, Гуанпэн Ли
Цель: Исследовать специфическую функцию CCR7 в иммунном механизме LIHC и сконструировать связанную с CCR7 иммунную прогностическую сигнатуру (IPS) для пациентов с LIHC.
Методы: Данные РНК-секвенирования LIHC были загружены из набора данных TCGA, и образцы были разделены на группы CCR7 _H и CCR7 _L. Затем были проведены анализ ssGSEA, анализ иммунного микроокружения, анализ уровня экспрессии генов HLA и генов контрольных точек. Были проведены дифференциальные экспрессионные иммунные гены (DEIG), и LASSO Cox был применен для построения IPS, связанных с CCR7 . Была построена новая номограмма для прогнозирования уровня выживаемости пациентов с LIHC.
Результаты: Иммунный счет, стромальный счет и счет ESTAMATE выше в группе CCR_H, в то время как чистота опухоли выше в группе CCR _L. В группе CCR7 _H гены HLA и гены иммунных контрольных точек имеют более высокие уровни экспрессии. Группы CCR7 _H имеют благоприятный прогноз, чем группа CCR7 _L. Было идентифицировано 903 DEIG. DEIG в основном обогащены активацией комплемента, адаптивным иммунным ответом, активацией Т-клеток, дифференцировкой лимфоцитов и взаимодействием цитокин-цитокиновых рецепторов. IPS состоит из 10 генов, включая GHV4-59, SCML4, AKR1B10, LINC00426, TRGC1, F2RL2, TRBV10-3, SAMD9L, SLC4A10 и ROR2 . Одномерный и многомерный анализ Кокса показал, что IPS является независимым прогностическим фактором LIHC.
Заключение: Связанные с CCR7 IPS и номограмма были построены и предоставлены пациентам с LIHC для прогнозирования уровня выживаемости. Это исследование предоставило новый способ анализа прогностического эффекта экспрессии CCR7 с точки зрения иммунологии.