Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Биоинформатический анализ фенилацетальдегидсинтазы (PAAS), белка, участвующего в образовании цветочного аромата у розы

Акбар Карами Самира Жандуст и Эсмаил Эбрахими

Цветы розы производят и выделяют ароматические летучие вещества 2-фенилацетальдегид (PAA) и 2-фенилэтанол (2-PE), которые имеют характерный цветочный/розоподобный запах. Предыдущие исследования розы показали, что, подобно цветам петунии, PAA образуется из L-фенилаланина через пиридоксаль-5'-фосфат-зависимую декарбоксилазу L-ароматической аминокислоты. Последовательность фенилацетальдегидсинтазы розы (RhPAAS) гомологична фенилацетальдегидсинтазе петунии (PhPAAS). Поскольку экспериментальных данных о различных структурных свойствах этого белка PAAS не так много, в настоящем исследовании мы изучили различные структурные свойства белка PAAS у петунии и розы с помощью инструментов биоинформатики. Были сравнены особенности первой, вторичной и третичной структур этого белка у петунии и розы. Результаты показали, что частота отрицательно заряженного лейцина и частота дипептидов Ser-Leu, Pro-Glu, Phe-Ser и Thr-Thr в петунии больше, чем в розе. Напротив, в петунии частоты гидрофобных и гидрофильных остатков, α-спирали, β-слоя, β-тяжей петунии ниже, чем в розе. Характеристики, полученные в этом исследовании, также могут дать полезные подсказки для проектирования путей производства запаха с использованием методов белковой инженерии.