Клиническая педиатрия: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Циркулирующие Y-РНК: прогнозируемая функция, главным образом, в контроле врожденной иммунной системы, клеточной сигнализации и репликации ДНК у детей с пилоцитарной и диффузной астроцитомой

Хуан Мануэль Родригес-Корона, Рут Руис Эспарса-Гарридо, Хорхе Виктор Орта Вега Мигель, Анхель Веласкес Флорес

Предыстория: Y-РНК — это небольшие некодирующие РНК, впервые выявленные у пациентов, страдающих синдромом Шегрена и красной волчанкой, имеющие различные предсказанные клеточные функции. Y-РНК — это очень распространенные некодирующие РНК, присутствующие в сыворотке, и только немногие из них известны относительно их молекулярных ролей.

Цель: Целью исследования было определение экспрессии циркулирующих Y-РНК в сыворотке крови детей с пилоцитарной или диффузной астроцитомой.

Материалы и методы: Экспрессия Y-РНК определялась с помощью массивов Human Transcriptome Array (HTA) 2.0. Кроме того, биоинформатическая аппроксимация возможных биологических функций Y-РНК определялась с помощью алгоритмов Random Forest (RF) и Vector Support Machine (VSM).

Результаты: Данные показали дифференциальную экспрессию RNY-3, RNY-4 и RNY-5 у детей с астроцитомой по сравнению с контролем. Между тем, было показано, что RNY-1 был повышен в диффузном состоянии по сравнению с пилоцитарным. Биоинформационный анализ показал, что RNY-4 и RNY-5 имели самые высокие баллы взаимодействия с клаудином, Toll-подобными рецепторами и гиалуронидазой-1. Кроме того, домен петли Y-РНК сам по себе имел самые высокие баллы взаимодействия с рецептором В-клеток CD22 (RNY-3) и Toll-подобными рецепторами 7 и 3 (RNY-4).

Заключение: Наши результаты впервые продемонстрировали дифференциальную экспрессию циркулирующих Y-РНК в детской астроцитоме, что позволяет отличить детей без рака от пациентов с детской диффузной или пилоцитарной астроцитомой и их потенциальное участие в регуляции различных биологических процессов, таких как активация-подавление иммунной системы, клеточная сигнализация, избирательная транскрипция и пролиферация клеток посредством активации репликации ДНК.