Журнал противовирусных и антиретровирусных препаратов
Открытый доступ

Абстрактный

Сравнительное исследование филогенетического анализа гена S1 изолятов вируса инфекционного бронхита из Ирака с выбранными штаммами (генный банк)

Нур Р. Абади*, Фирас Аль-Бави

Недавно, в 2018 году, четыре штамма вируса инфекционного бронхита (IBV) были выделены из вакцинированных и невакцинированных стад бройлеров с разных птицеводческих ферм в разных городах Ирака. Патогенные свойства были оценены для четырех штаммов IBV. Тестовые цыплята были инфицированы четырьмя штаммами, вызывающими иммунный ответ. Заметные результаты были получены с помощью анализов перекрестной нейтрализации, которые показали, что штаммы антигенно отличаются от классических штаммов IBV H120, M41, Conn и Gray. По сравнению с вакцинным штаммом H120, короткая вставка, точечная мутация и делеция произошли во многих положениях в белке S1 четырех штаммов. Два из четырех штаммов имели мотив (HRRRR), который считался идентичным мотиву эпидемических штаммов IBV в Ираке. Еще два штамма имели новые мотивы (HRLRR и RRYRR), возникшие в изолированных штаммах. Эти четыре штамма также генетически отличались от штаммов вакцины и неиракских штаммов IBV, но были тесно связаны с большим количеством штаммов США и Китая, Сингапура и Индии. Изоляты и 14 референтных штаммов IBV были сгруппированы в три отдельные группы (I-III). Четыре штамма были отнесены к группам III, образуя большую филогенетическую ветвь, которая тесно связана с штаммами IBV США и Сингапура, тогда как штаммы вакцины, принадлежащие к группам I и II, генетически далеки от групп III. Результаты этого исследования показывают, что в популяции кур в Ираке циркулируют различные штаммы IBV.