Микобактериальные заболевания
Открытый доступ

Абстрактный

Частота полиморфизмов гена NRAMP1 среди коренных народов Канады, страдающих эндемическим туберкулезом

Линда А. Ларкомб, Нилоффер Мукерджи, Эндрю М. Лодж, Джоди С. Браун, Лизетт Денечеже, Питер В. Никерсон и Памела Х. Орр

Цели: Естественный белок макрофагов 1, ассоциированный с резистентностью (NRAMP1), регулирует восприимчивость к инфекционным и аутоиммунным заболеваниям. Полиморфизмы гена NRAMP1 связаны с восприимчивостью к туберкулезу. Поэтому частота полиморфизмов гена NRAMP1 была оценена в трех подгруппах коренных народов Манитобы (дене, кри и солто) с различными, но высокими показателями туберкулеза (636/100 000, 496/100 000 и 0/100 000 соответственно).

Методы: Образцы венозной крови были собраны у 281 участника исследования из трех подгрупп коренных народов (дене (N=108), кри (N=41), сото (N=49)) и некоренной канадской (европейского происхождения) группы (N=83). Геномная ДНК была извлечена, и четыре однонуклеотидных полиморфизма в гене NRAMP1 (5′ (GT)n, -274 (C/T), интрон 4 (469+14 G/C), D543N (G/A)) были генотипированы с использованием полиморфизма длины рестрикционных фрагментов. Частоты аллелей SNP NRAMP1 были подсчитаны и сравнены между исследуемыми подгруппами.

Результаты: Подгруппа дене имела значительно отличающиеся частоты аллелей NRAMP1 (5′(GT)n, -274 (C/T), интрон 4(G/C), D543N (G/A)) по сравнению с группой европейского происхождения. Частоты аллелей NRAMP1 в D543N (G/A) и интроне 4(G/C) значительно различались между группами кри и европейского происхождения, в то время как частоты аллелей у сото существенно не отличались от группы европейского происхождения. Две подгруппы (дене и кри) имели более высокую частоту аллеля NRAMP1 D543N (A), который связан с туберкулезом в других популяциях.

Заключение: Высокие, но дифференцированные показатели заболеваемости туберкулезом среди подгрупп коренных народов Манитобы связаны с социальными детерминантами здоровья (например, бедность, расизм, неадекватное жилье), но другие потенциальные факторы риска, такие как полиморфизм генов, связанный с туберкулезом, только недавно стали объектом исследования. Было обнаружено, что частоты аллелей NRAMP1 различаются по сравнению с дене, кри и солто, и их роль в восприимчивости/устойчивости к туберкулезу требует дальнейшего изучения.