ISSN: 2167-0870
Чжэнцзюнь Чжан
Поиск генов, биологически напрямую или косвенно связанных с раком легких, привлек большое внимание, и было сообщено о многих генах, напрямую связанных с раком легких. Однако не было подтверждено, действительно ли эти опубликованные «ключевые» гены являются критическими для формирования рака легких, т. е. они могут иметь очень ограниченную полезную информацию. В результате поиск основных генов остается сложной проблемой исследования рака легких. Используя недавно разработанный метод конкурирующего линейного факторного анализа при обнаружении дифференциально экспрессируемых генов, мы продвигаем изучение обнаружения критических генов рака легких на однородно информативный уровень. Набор из четырех общих генов и их функциональные эффекты были обнаружены как дифференциально экспрессируемые в опухолевых и неопухолевых образцах со 100% чувствительностью и 100% специфичностью в одном исследовании аденокарциномы легких (LUAD) и одном исследовании плоскоклеточного рака легких (LUSC) (две североамериканские когорты с 20429 генами, 576 и 552 образцами соответственно). Два дополнительных анализа также достигают точности 97,8% чувствительности и 100% специфичности в одном исследовании немелкоклеточного рака легких (NSCLC, европейская когорта с 20356 генами и 156 образцами) и точности 100% чувствительности и 95% специфичности (1 из 20 неопухолевых образцов) в одном исследовании ALK-положительных и EGFR/KRAS/ALK-отрицательных аденокарцином легких (LUAD, японская когорта с 20356 генами и 224 образцами). Есть некоторые общие гены, но разные функциональные эффекты в каждом наборе из четырех генов среди двух североамериканских когорт и европейской когорты, а также среди североамериканских когорт и японской когорты. Эти результаты показывают, что классификаторы на основе четырех генов надежны для разных типов рака легких и разных расовых когорт и точны. Функциональные эффекты четырех генов раскрывают существенно другие механизмы (тайны) между LUAD и LUSC. Эти наборы из четырех генов и их функциональные эффекты считаются необходимыми для исследований и практики рака легких. Функциональные эффекты этих генов естественным образом классифицируют пациентов по разным группам (более семи подтипов). Информация о подтипах полезна для персонализированной терапии. Новые результаты могут мотивировать новые исследования рака легких в более сфокусированных и целевых направлениях для спасения жизней, защиты людей и снижения огромных экономических затрат на исследования и лечение рака легких.