Журнал рыболовства и аквакультуры
Открытый доступ

Абстрактный

Генетическое разнообразие в культурной и дикой популяциях Clarias gariepinus (Burchell, 1822) в Нигерии с использованием случайной амплифицированной полиморфной ДНК (RAPD) и микросателлитной ДНК

Майкл О Аводиран* и Олумид Афолаби

Структура популяции и генетическое разнообразие Clarias gariepinus из культивируемой популяции на ферме Чи (Аджанла) и дикой популяции в водохранилище Аседжире (Аседжире) были проанализированы с использованием случайной амплифицированной полиморфной ДНК (RAPD) и микросателлитных ДНК-маркеров. Используя протокол CTAB, геномная ДНК была извлечена из хвостовых плавников 20 образцов живых особей, собранных из каждой популяции. Семь праймеров RAPD и семь пар микросателлитных ДНК-праймеров были использованы для амплификации различных локусов на извлеченной геномной ДНК с помощью полимеразной цепной реакции, и полученные фрагменты ДНК были проанализированы на агарозном геле. Праймеры RAPD амплифицировали в общей сложности 474 локуса с 697 полосами во всех образцах для семи изученных праймеров. Культивируемая популяция с фермы Чи показала в общей сложности 366 полос, в то время как дикая популяция из водохранилища Аседжире показала 331 полосу. Культивируемая популяция показала отрицательный коэффициент инбридинга (F) -0,173 ± 0,209, что статистически предполагает избыточную гетерозиготность, в то время как положительный, но низкий коэффициент инбридинга 0,042 ± 0,243 был оценен для дикой популяции. Анализ молекулярной дисперсии (AMOVA) для обоих генетических маркеров показал значительную разницу (p=0,01) между двумя популяциями. Результат исследования предполагает потерю или продолжающуюся потерю генетической изменчивости, которая требует вмешательства по сохранению в двух изученных популяциях.