Разработка лекарств: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Определение связывающей способности пептидов TAP для разработки вакцины на основе фрагментов длинного нейротоксина 2 [ N. naja ]

Шерхане АС и Гомасе ВС

Длинный белок нейротоксина 2 из яда Naja naja демонстрирует большое сродство к ацетилхолиновым рецепторам, что вызывает периферический паралич, блокируя нервно-мышечную передачу на постсинаптическом участке. В этом исследовании мы используем каскадный метод SVM на основе TAPPred, который обнаружил 26 высокоаффинных пептидных участков транспортера TAP. TAP представляет собой гетеродимерный трансмембранный белок, который транспортирует антигенные пептидные белки в эндоплазматический ретикулум, где он связывается с молекулами MHC класса I. Эти комплексы MHC-пептид будут транслоцироваться на поверхность антигенпрезентирующих клеток (APC), где они распознаются рецепторами Т-клеток, чтобы вызвать иммунный ответ. Таким образом, прогнозирование пептидов, связывающих TAP, полезно для идентификации ограниченных MHC класса I эпитопов Т-клеток и, следовательно, полезно для разработки синтетической пептидной вакцины.