ISSN: 2157-7609
Шерхане АС, Чанбхале СС и Гомасе ВС
Длинный нейротоксин 1 — опасный белок, встречающийся в N. melanoleuca. Это очень опасная змея из-за количества яда, впрыскиваемого за один укус. Пептидные фрагменты антигенного белка длинного нейротоксина 1 N. melanoleuca, имеющие 71 аминокислоту, что показывает 63 наномера, могут использоваться для выбора наномеров для использования в разработке синтетических пептидных вакцин и для улучшения понимания роли иммунной системы против укуса змеи. Мы используем для применения алгоритма вычислительного интеллекта PSSM (матрицы оценки положения) для прогнозирования связывающих пептидов MHC класса I, мы также прогнозируем антигенность, доступность растворителя, полярные и неполярные остатки для анализа областей, охватывающих мембрану (гидрофобных) или областей, которые, вероятно, экспонируются на поверхности белков (гидрофильные домены), которые являются потенциально антигенными, что позволяет потенциальным лекарственным мишеням идентифицировать активные сайты для защиты хозяина от укусов змей и для разработки синтетической пептидной вакцины.