Иммунные исследования
Открытый доступ
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Идрис А.Б., Махмуд С.М., Мохамед Эламин С., Мустафа Й.Ю., Осман А.А., Адам М.Е., Али Л.Б., Аббас М.Х., Абу-Хараз А.Х., Абдельрахман К.А. и Салих М.А.
Вирус Sin Nombre является патогеном категории A с зарегистрированным уровнем смертности от 30% до 50%. Он был ответственен за вспышку в национальном парке Йосемити в 2012 году. До сих пор специфическая терапия для лечения HCPS, вызванного SNV, недоступна. Несмотря на многочисленные усилия по разработке безопасных и эффективных вакцин против SNV, включая традиционные подходы, а также подходы с использованием молекулярных вакцин, на сегодняшний день не существует вакцин, доказавших свою высокую эффективность против SNV. В нашем исследовании мы проанализировали оболочечный гликопротеин и нуклеокапсид SNV с помощью инструментов иммуноинформатики, размещенных в ресурсах IEDB; для того, чтобы определить наиболее консервативные и иммуногенные эпитопы для B- и T-клеток. Затем прогнозируемые эпитопы были оценены для охвата популяции против всей мировой популяции с ограниченными аллелями MHC-I и MHC-II. Среди предсказанных эпитопов для В-клеток лучшими кандидатами на гликопротеин и нуклеокапсид были эпитоп 743CKKYAYPWQT752 и эпитоп 271QVDESKVS278 соответственно. Для предсказанных эпитопов гликопротеина CD8+ Т-клеток были выбраны эпитопы 208MTLPVTCFL216 и 458YTFTSLFSL466. Интересно, что лучшими кандидатами на эпитопы для нуклеокапсида были эпитопы 25YILSFALPI133 и 239FLAARCPFL247, которые имели высокую аффинность для взаимодействия с обоими классами MHC, I и II, и они имели превосходное покрытие популяции для аллелей классов I и II по всему миру. Насколько нам известно, наше исследование впервые предсказало коктейль из В- и Т-клеточных эпитопов для разработки эффективной вакцины против HCPS, вызванного SNV