Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Индукция нейтрализующих антител против мутализина-II из яда змеи Lachesis muta muta, вызванная конформационным эпитопом В-клеток, предсказанным с помощью базы данных о ужалениях Blue Star

Рикардо Андрес Мачадо-де-Авила, Мариана Веллозо, Дайсиан Оливейра, Стефани Странски, Ана Флор-Са, Франсиско С. Шнайдер, Горан Нешич и Карлос Чавес-Олортеги

Мутализин-II из яда змеи Lachesis muta muta является эндопептидазой с геморрагической активностью. Для идентификации конформационного эпитопа мы использовали Blue Star Sting, последнюю версию веб-ориентированного Sting Millenium Suite, в качестве альтернативного инструмента вычислительного анализа для выбора и проектирования пептидов. Предварительно выбранные пороговые значения параметров доступности и гидрофильности использовались для выбора аминокислотных остатков в качестве потенциальных конформационных эпитопов. Пептид (P117-Y116-C115-Q194-C195-L197-N198-K199-P200-Y5-L48) был вручную нарисован в пакете Swiss-PDB-Viewer и синтезирован с помощью Fmoc-синтеза. Иммунизация кроликов этим пептидом индуцировала антитела, которые распознавали Мутализин-II и защищали от геморрагических факторов, присутствующих в яде Lachesis. Sting Millennium Suite смог предсказать конформационные эпитопы в этом классе белков. Три аминокислоты (K199, Y5 и L48) были идентифицированы как существенные во взаимодействии между пептидом и нейтрализующими антителами.