Транскриптомика: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Интеграция сети коэкспрессии генов, анализ обогащения GO для идентификации сигнатуры экспрессии генов инвазивной карциномы мочевого пузыря

Ханаа Хибиши Габаллах

Карцинома мочевого пузыря является наиболее распространенной злокачественной опухолью мочевыводящих путей. Определение генетических биомаркеров инвазивности опухоли поможет в ранней диагностике и правильном лечении. Настоящее исследование направлено на интеграцию сети коэкспрессии и анализа обогащения GO для идентификации прогностических маркеров и ключевых генов, которые способствуют возникновению и прогрессированию рака мочевого пузыря, с использованием набора данных ДНК-микрочипов (GSE 37317), инвазивные и неинвазивные гены рака мочевого пузыря сравнивались с применением взвешенной сети коэкспрессии генов, онтологии генов и анализа путей. В этом исследовании были определены гены-кандидаты (PURA, SRPK2, TRAK1, BRD2 и UPF3), которые могут играть значительную роль в прогрессировании и инвазивности карциномы мочевого пузыря. Эти маркеры могут помочь в ранней диагностике мышечной инвазивности рака мочевого пузыря. В заключение: эти открытия могут обеспечить лучшее понимание молекулярного механизма прогрессирования и инвазивности рака мочевого пузыря.