ISSN: 2471-9315
Маулин Прамод Шах и Редди ГВ
Автотрофные аммиакокисляющие бактерии являются критическим фактором микробного сообщества в промышленных системах очистки сточных вод. Мы оценили разнообразие и состав сообщества β-протеобактериальных аммиакокисляющих бактерий в двух полномасштабных реакторах очистки - песчаном фильтре и биологическом аэрируемом фильтре - получающих идентичные сточные воды. Полимеразная цепная реакция фрагментов гена 16S рРНК аммиакокисляющих бактерий - селективных праймеров была объединена с денатурирующим градиентным гель-электрофорезом для обеспечения сравнительного анализа доминирующих популяций аммиакокисляющих бактерий. Филогенетическое сродство доминирующих аммиакокисляющих бактерий было проверено путем клонирования и секвенирования фрагментов гена 16S рРНК, амплифицированных полимеразной цепной реакцией. Профили денатурирующего градиентного гель-электрофореза были оценены с использованием индекса сходства, основанного на вероятности. Использование вероятностного индекса сходства позволило нам считать, что различия и сходства, наблюдаемые в структуре сообщества аммиакокисляющих бактерий в разных образцах, были статистически значимыми или могли быть объяснены случайным соответствием полос в профилях денатурирующего градиентного гель-электрофореза, которые предполагали бы случайную колонизацию реакторов различными аммиакокисляющими бактериями. Все распознанные потенциально похожие последовательности сгруппированы в пределах рода Nitrosomonas. Большее разнообразие аммиакокисляющих бактерий было обнаружено в капельных фильтрах, чем BAF во всех проанализированных образцах, инициированных доминированием аммиакокисляющих бактерий, наиболее тесно связанных с Nitrosococcus mobilis. Численное исследование профилей денатурирующего градиентного гель-электрофореза показало, что сообщество аммиакокисляющих бактерий в глубинных профилях из фильтрующих слоев было выбрано неслучайным образом.