Журнал противовирусных и антиретровирусных препаратов
Открытый доступ

Абстрактный

Филогенетический анализ вируса свиного гриппа H1N1, изолированного в Индии

Нутан Пракаш, П. Деванги, К. Мадхуури, П. Кхушбу и П. Дипали

Подтип H1N1 вируса гриппа А является возбудителем свиного гриппа. Вспышка 2009 года, вызванная подтипом H1N1 у людей, произошла из-за передачи вируса свиного гриппа от свиньи к человеку. Таким образом, чтобы проанализировать происхождение этого нового вируса, мы сравнили 42 последовательности нуклеокапсида вирусов H1N1 разного происхождения. Филогенетический анализ этих последовательностей был проведен вместе с бутстреп-анализом 100 репликатов. Построенное филогенетическое дерево показало, что штамм Indian H1N1 показал самую высокую гомологию со штаммом Iowa H1N1, а также со штаммом Wisconsin H1N1. Кроме того, штаммы H1N1, проанализированные с использованием последовательностей NP разного индийского происхождения, показали очень близкое сходство последовательностей. Следовательно, в будущем это исследование будет полезно для изучения таксономии и эволюции вирусов гриппа.