Иммунные исследования
Открытый доступ
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Мутураман Сатьямурти, Бьорн Питерс, Хюйнь-Хоа Буй, Джон Сидни, Джон Мокили, Стивен С. Уилсон, Уорд Флери, Дебора Л. МакГиннесс, Филип Э. Борн и
Эпитопы можно определить как молекулярные структуры, связанные со специфическими рецепторами, которые распознаются во время иммунных реакций. Проект Immune Epitope Database and Analysis Resource (IEDB) будет каталогизировать и организовывать информацию, касающуюся эпитопов антител и Т-клеток от инфекционных патогенов, экспериментальных антигенов и аутоантигенов, с приоритетом на патогены категории AC NIAID (http://www2.niaid.nih.gov/Biodefense/bandc_priority.htm) и возникающие/повторно возникающие инфекционные заболевания. Будут каталогизированы как внутренние структурные и филогенетические особенности, так и информация, касающаяся взаимодействия эпитопов с иммунной системой хозяина. Описание: Для эффективного представления и передачи информации, связанной с иммунными эпитопами, была разработана формальная онтология. Семантика домена эпитопа и связанных с ним понятий была зафиксирована в виде иерархии классов, которые представляют общие и специализированные отношения между различными понятиями. Полный список классов и их свойств можно найти на http://www.immuneepitope.org/ontology/index.html. Заключение: Онтология IEDB является первой онтологией, специально разработанной для сбора как внутренней химической, так и биохимической информации, касающейся иммунных эпитопов, с информацией, касающейся взаимодействия этих структур с молекулами, полученными из иммунной системы хозяина. Мы ожидаем, что разработка этого типа онтологии и связанных с ней баз данных будет способствовать строгому описанию данных, связанных с иммунными эпитопами, и в конечном итоге может привести к совершенно новым методам описания и моделирования иммунных реакций.