Микобактериальные заболевания
Открытый доступ

Абстрактный

Выявление мутаций в гене rpob клинически изолированного M. Tuberculosis методом секвенирования ДНК

Сония Шарма и Молли Мадан

Цель: Было проведено популяционное исследование для выявления мутаций в 81-пн области, определяющей устойчивость к рифампицину (RRDR) гена rpoB в клинически изолированных штаммах M. tuberculosis.

Методы : Для быстрого выявления устойчивости M. tuberculosis к рифампицину использовалось прямое секвенирование ДНК с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Результаты: Среди 150 изолятов 115 были чувствительны к рифампицину и демонстрировали дикий тип при прямом секвенировании с помощью ПЦР, а остальные 35 изолятов оказались резистентными. Наиболее часто в мутации участвовали кодоны 531 (40%), 526 (23%) и 516 (15%). Всего было обнаружено двадцать четыре вида мутаций, из которых 18 точечных мутаций, 4 вставки и 2 делеции были обнаружены в 81-пн RRDR-области гена rpoB.

Заключение : Анализ секвенирования для генотипической оценки устойчивости к рифампицину является высокочувствительным анализом и представляет собой практическую альтернативу тестированию in vitro в M. tuberculosis. Информация о профиле мутаций rpoB в M. tuberculosis обеспечивает улучшенную диагностику устойчивости к рифампицину за счет повышения эффективности теста на основе секвенирования генов.