Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Несоответствия HLA и трансплантация гемопоэтических клеток: структурное моделирование оценивает влияние изменений в специфичности связывания пептидов на результат трансплантации

Чен Яновер, Эффи В. Петерсдорф, Мари Малкки, Тед Гули, Стивен Спеллман, Андреа Веларди, Питер Барди, Алехандро Мадригал, Жан-Дени Биньон, Филип Брэдли

Успех трансплантации гемопоэтических клеток от неродственного донора частично зависит от степени соответствия человеческого гистосовместимого лейкоцитарного антигена (HLA) между донором и пациентом. Мы представляем структурный анализ несовпадения HLA, фокусируясь на отдельных несовпадениях аминокислот и их влиянии на специфичность связывания пептидов. Используя молекулярное моделирование взаимодействий HLA-пептид, мы находим доказательства того, что несовпадения аминокислот, которые, как прогнозируется, нарушают специфичность связывания пептидов, связаны с более высоким риском смертности в большом и разнообразном наборе данных пар пациент-донор, собранном Международной рабочей группой по гистосовместимости в консорциуме по трансплантации гемопоэтических клеток. Этот анализ может представлять собой первый шаг к прогнозированию относительного риска несовпадений аллелей HLA на основе последовательности