Разработка лекарств: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Информация о поверхностной доступности пептидных фрагментов белка оболочки вируса мозаики люцерны (ВМЛ) на физико-химическом и иммунохимическом уровнях

Гомасе ВС и Кале КВ

Вирус мозаики люцерны (AMV) поражает более 600 видов растений в 70 семействах (экспериментальные и естественные хозяева). Белки оболочки являются важными материалами для создания структурно-функциональных корреляций с биологически активными пептидами на физико-химическом и иммунохимическом уровнях, а также являются хорошими моделями для наблюдения за эволюционными изменениями в молекулах белков. Антигенные пептиды в позиции 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21; 151-PTHAGMQNQNF-161; 22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44 белка оболочки вируса мозаики люцерны наиболее подходят для разработки субъединичной вакцины, поскольку с одним эпитопом иммунный ответ может быть сгенерирован в большой популяции. В этом исследовании мы использовали алгоритмы PSSM и SVM для прогнозирования связывающего пептида MHC класса I и II, антигенности, доступности растворителя, полярных и неполярных остатков для анализа областей, которые, вероятно, находятся на поверхности белков, которые являются потенциально антигенными, что позволяет потенциальным лекарственным мишеням идентифицировать активные участки против инфекции, а также разрабатывать синтетическую пептидную вакцину.