ISSN: 2456-3102
Jocelyn De Wever
Исследования генетического разнообразия растений имеют большое значение для эффективных стратегий общения с растениями и ресурсов (например, борьба с неправильной маркировкой, сохранение ценного генетического материала, анализ происхождения и исследования генетического разнообразия), поскольку они способствуют расширению знаний о генетическом фоне и разнообразии конкретных растений. Эти исследования чаще всего анализируются с помощью простых и эффективных методов генотипирования с использованием генетических маркеров, таких как SSR, однако SNP приобретают все больший интерес. Недавно был предложен экономически эффективный метод на основе qPCR для целей генотипирования SNP, названный doublemismatch allele-specific (DMAS) qPCR как дешевая альтернатива методу -sample и multilocus, основанному на прямом считывании технологии qPCR на основе ДНК-связывающего красителя. Его разработка, оптимизация, валидация и применение на Theobroma cacao L., важной товарной культуре, используемой в производстве шоколада, оказались успешными. Он предложил ценные знания о фоне какао, которое часто страдает от неправильной маркировки и неэффективных и ограниченных ресурсов управления. Метод, оптимизированный здесь, показал 98,05% эффективности в определении правильного генотипа какао и идентифицировал 15,38% нетипичных и два дубликата в международно признанной популяции какао (n=65), используя ограниченное количество маркеров (n=42). Кроме того, для дифференциации всех проанализированных образцов потребовалось всего 13 маркеров. Примечательно, что описанный метод можно легко оптимизировать и внедрить в любой молекулярно-биологической лаборатории для широкого спектра целей и организмов, например, для обнаружения мутаций и для облегчения картирования генов и селекции с помощью маркеров в целях селекции.