Химиотерапия: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Прогностический маркер ММП9, связанный с инфильтрацией иммунных клеток в микроокружении опухоли при раке мочевого пузыря

Хань-Шэн Линь, Ван-Ван Лю, Нэн-Чжо Фэн, Шуан-Цзе Чжун, Шан-Цзинь Чен, Цзин-Вэй Хэ*, Цзянь Лян*

Предыстория: Рак мочевого пузыря (BLCA) является одним из наиболее распространенных видов рака у человека, его заболеваемость растет, особенно у женщин. Микросреда опухоли (TME) играет важную роль в развитии и прогрессировании опухоли. Мы изучили профили экспрессии BLCA в базе данных программы Cancer Genome Atlas и исследовали гены, которые могут влиять на состав микросреды опухоли (TME). Затем мы проанализировали связь между генами и прогнозом опухоли, ища иммунные прогностические маркеры, которые могут привести к новым стилям диагностики и лечения BLCA.

Методы: Мы получили данные РНК-секвенирования BLCA из The Cancer Genome Atlas (TCGA); использовали алгоритм данных Estimation of Stromal and Immunune Cells in the Malignant Tissues Expression (ESTIMATE) для вычисления иммунного и стромального балла. Дифференциально экспрессируемые гены были выполнены в регрессионном анализе COX и использованы для построения сети белок-белкового взаимодействия (PPI).

Результаты: Анализ пересечения показал, что матричная металлопротеиназа-9 ( MMP9 ) является единственным кроссоверным геном. Мы вычислили процент иммунных клеток, инфильтрирующих опухоль (TICs) в BLCA с помощью алгоритма идентификации типа клеток путем оценки относительных подмножеств транскриптов РНК (CIBERSORT). Были установлены различия в группах с высокой и низкой экспрессией MMP9 в TIC. Затем были сопоставлены уровни экспрессии MMP9 в каждом виде TIC. С помощью анализа выживаемости, клинического анализа и анализа обогащения было обнаружено, что MMP9 является иммунным прогностическим фактором для BLCA и играет важную роль в микроокружении опухоли. В конечном счете, корреляционный анализ между MMP9 и генами иммунных контрольных точек показал, что MMP9 может прогнозировать эффект иммунотерапии на BLCA.

Заключение: MMP9 является геном иммунного прогностического маркера. MMP9 участвует в регуляции иммунологического процесса BLCA через множество путей и тесно связан с иммунными мишенями PD-1 и CTLA4. Экспрессия MMP9 может влиять на прогноз BLCA, указывая на то, что он может быть прогностическим маркером BLCA.