Ферментная инженерия
Открытый доступ

Абстрактный

Подтипирование глиомы путем объединения данных экспрессии генов и CNV на основе подхода компрессионного зондирования.

Санджай Шарма

В последнее время развитие биостратегий позволяет специалистам собирать различные виды информации из обследования, например, информацию о качественной артикуляции, информацию о SNP и информацию о вариациях числа копий (CNV). Превосходный результат может быть получен в зависимости от объединения различных видов информации, чем от использования любой индивидуальной информации. Объединенное исследование с различными видами информации оценок по всему геному — это не другая идея, однако постоянно изучается, как их эффективно объединить для органического раскрытия. Онлайн-платформа под названием Magellan была создана для объединенного исследования числа дубликатов ДНК и информации о артикуляции при злокачественном росте яичников. Magellan обнаружила заслуживающую внимания связь между качеством артикуляции и выносливостью пациента. построила байесовскую структуру для объединения разнородных информационных горячих точек для прогнозирования емкости качества. Улучшенная точность группировок качества была достигнута по сравнению с исследованием микрочипов в одиночку. Измеримые вычисления обучения на основе частей также использовались в объединенном исследовании различных наборов данных по всему геному. Некоторые объединенные стратегии исследования требуют, чтобы наборы данных имели схожую дисперсию; необходимо изменить наборы данных, чтобы они имели схожую дисперсию перед исследованием. В последнее время интегративная методология, объединяющая связь, качественную артикуляцию и принадлежность, была учтена для распознавания качеств заявителя, управляющих BMD. Консолидированный подход к исследованию, предложенный в этой работе, не имеет особой необходимости в типах данных или присвоении данных. Чтобы проверить адекватность нашей методологии, мы применили ее к подтипированию гилиом. Глиомы — это опухоли, которые начинаются в мозге или позвоночнике и возникают из глиальных клеток. Глиомы — это наиболее известный вид основных опухолей мозга у взрослых. Порядок глиом может быть основан на типе клеток, оценке и области. Например, глиомы можно разделить на второсортные и высокосортные, контролируемые патологической оценкой опухоли. В этом исследовании мы характеризуем подтипы в зависимости от наследственных и атомных меток в соответствии со ссылкой. Порядок подтипов глиомы привлек массу соображений и был изучен многими исследовательскими собраниями. Большая часть работ была основана на качественной артикуляционной информации. Было учтено, что четыре подтипа глиом, олигодендроглиома, анапластическая олигодендроглиома, анапластическая астроцитома и глиобластома мультиформная, могут быть распознаны только двухкачественными или трехкачественными смесями. Он собрал k-ближайшую модель с 20 основными моментами для группировки 28 глиобластом и 22 анапластических олигодендроглиом. Было гарантировано, что класс