Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Остатки триптофана из слота связывания кэпа в семействе eIF4E: их вклад в спектры кругового дихроизма в ближнем УФ-диапазоне

Джоанна Зуберек* и Агнешка Стельмаховска

eIF4E, ключевой фактор в зависимой от кэпа инициации трансляции, связывает структуру кэпа на 5'-конце мРНК посредством стекинг-взаимодействия с участием двух из восьми консервативных остатков триптофана. В этой статье мы изучили индивидуальные вклады остатков триптофана в спектры кругового дихроизма в ближнем УФ-диапазоне для выявления структурных сходств и различий в мотиве связывания кэпа среди членов семейства eIF4E. Спектр КД в ближнем УФ-диапазоне человеческого eIF4E1a в его апо-форме, возникающий в основном из-за перехода 1Lb и доминируемый двумя вибриональными полосами, является консервативным среди eIF4E. На основе сравнения спектров КД для мутантов eIF4E мы показали, что триптофаны, участвующие во стекинг-взаимодействии, дают самые сильные индивидуальные вклады, которые позволяют идентифицировать их различную ориентацию по отношению к кэпу. Это указывает на то, что КД в ближнем УФ-диапазоне является быстрым и мощным инструментом для анализа конформации триптофана в белках eIF4E и их изменений при связывании модифицированных аналогов кэпа.