Журнал медицинских методов диагностики
Открытый доступ

Абстрактный

Диагностическая эффективность мультиплексной ПЦР при выявлении микроорганизмов пневмонии в мокроте ВИЧ-инфицированных пациентов в Уганде

Дэниел Орит, Уильям Вородрия, Альфред Андама, Генри Каджумбула, Эммануэль Манде, Ричард Квизера

Предыстория: Пневмония остается частой причиной заболеваемости и смертности среди ВИЧ-инфицированных людей в странах Африки к югу от Сахары. Заболевание с таким бременем требует соответствующей диагностической модальности, чтобы обеспечить логический подход к руководству лечением. Обычные диагностические методы, хотя и доступны, не используются в полной мере из-за связанных с ними диагностических ограничений и, как таковые, представляют трудности для успешного лечения пневмонии. Поэтому необходимо оценить мультиплексный анализ полимеразной цепной реакции (ПЦР), который является быстрым, чувствительным и специфичным для обнаружения микроорганизмов пневмонии, тем самым сокращая время до антимикробной терапии.

Цель: Нашей целью было сравнить эффективность мультиплексной ПЦР-панели для диагностики пневмонии Bio Fire ^® Film Array ^® с составным эталонным стандартом.

Методы: В период с ноября 2019 года по февраль 2020 года мы провели диагностическое поперечное исследование среди ВИЧ-положительных клиентов, обращающихся за помощью в национальную больницу Mulago в Кампале. Все согласившиеся пациенты, соответствующие критериям включения, были обучены качественному сбору мокроты, и у них были получены два образца мокроты для анализа. Классификация Бартлетта проводилась по образцам мокроты до бактериального посева. Мультиплексные ПЦР-тесты проводились по вторым образцам мокроты. Данные анализировались с помощью STATA V14. В качестве золотого стандарта использовался составной эталон.

Результаты: По сравнению с составным эталонным стандартом чувствительность составила 90,3%, специфичность — 44,6%, положительная прогностическая ценность — 36,8%, отрицательная прогностическая ценность — 91,3%, площадь под ROC-кривой — 0,680, каппа-статистика — 0,23, а согласие между двумя тестами составило 57%.

Выводы: Высокая чувствительность и низкая специфичность, продемонстрированная методом мультиплексной ПЦР, делает его хорошим скрининговым тестом, но не подтверждающим тестом для обнаружения микроорганизмов пневмонии в мокроте.