Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Влияние вязкости и внешних сил на термическую денатурацию модели Пейрара-Бишопа

Хидаят В., Сулейман А., Вириди С. и Дзен Ф.П.

Исследовано влияние вязкости и внешних сил на термическую денатурацию ДНК модели Пейрарда-Бишопа. Расчет функции распределения для определения растяжения водородных связей был выполнен с помощью интегрального метода Монте-Карло по траектории. Результат показывает, что взаимодействие между вязким потенциалом и внешними силами препятствует идеальному распаковыванию ДНК, но позволяет ДНК разделяться на определенном расстоянии от ее исходного положения. Увеличение коэффициента вязкости приведет к снижению температуры плавления. Полученный результат также показал, как при определенной температуре внешний потенциал дает доминирующий вклад в денатурацию, даже более высокий, чем эффект вязкости.