Журнал инфекционных заболеваний и профилактической медицины
Открытый доступ

Абстрактный

Полное секвенирование генома для выявления зоонозного туберкулеза в Керетаро, Мексика

Клаудия Анжелика Переа Разо, Фелисиано Милиан Суазо, Изабель Барсенас Рейес, Сусана Соса Гальегос, Эльба Родригес Эрнандес, Сусана Флорес Вильяльва и Жерминаль Хорхе Канто Аларкон

В исследование было включено в общей сложности 2736 образцов мокроты, мочи и других жидкостей, собранных у 1154 пациентов с подозрением на туберкулез в Керетаро, Мексика. Кислотоустойчивое окрашивание и посев на селективных средах Стоунбринка и Левенштейна-Йенсена были выполнены для всех образцов. Генотипирование изолятов проводилось путем сполиготипирования и секвенирования всего генома с помощью однонуклеотидного полиморфизма (SNP). Полученные сполиготипы и SNP-типы Mycobacterium bovis сравнивались с таковыми у крупного рогатого скота, найденными в базе данных. Двадцать один (1,8%) изолят Mycobacterium был получен путем культивирования, все из мокроты; два (13%) были идентифицированы как M. bovis путем сполиготипирования, SB0673 и SB0971, которые часто встречаются у крупного рогатого скота в Мексике. Из общего числа изолятов, 15 были полностью секвенированы по геному, подтвердив, что два из них являются M. bovis . Паттерны SNP двух изолятов M. bovis от человека были аналогичны тем, которые были обнаружены у крупного рогатого скота в разных частях Мексики.